MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 1825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	AGA	2	6	26	31	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017472	ATG	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	AAT	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	TACTT	2	10	141	150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017472	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017472	AGA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017472	GAA	2	6	303	308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017472	AGT	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017472	GAA	3	9	342	350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017472	AAG	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017472	A	6	6	458	463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017472	AGA	2	6	487	492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017472	GAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017472	ATG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017472	AGA	2	6	617	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017472	ACT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017472	AT	3	6	683	688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017472	GACT	2	8	716	723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017472	ATT	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017472	AAGA	2	8	909	916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017472	GAA	3	9	948	956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017472	CTTCAA	2	12	986	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017472	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017472	TGA	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017472	GAA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017472	GAA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017472	AAAG	2	8	1292	1299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017472	A	6	6	1341	1346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017472	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017472	CAAAAA	2	12	1388	1399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017472	AAT	2	6	1418	1423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017472	T	6	6	1461	1466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017472	CTT	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017472	TTA	2	6	1494	1499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017472	T	6	6	1500	1505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017472	TTTA	2	8	1509	1516	25 %	75 %	0 %	0 %	385818463
37	NC_017472	ATCTGT	2	12	1690	1701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385818463
38	NC_017472	TAT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
39	NC_017472	AAT	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818463
40	NC_017472	TTA	2	6	1844	1849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
41	NC_017472	TAGGA	2	10	1875	1884	40 %	20 %	40 %	0 %	385818463
42	NC_017472	TAT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
43	NC_017472	TTTATT	2	12	1993	2004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385818463
44	NC_017472	TAT	2	6	2028	2033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
45	NC_017472	TTA	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
46	NC_017472	TAT	2	6	2064	2069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
47	NC_017472	TAT	2	6	2118	2123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
48	NC_017472	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
49	NC_017472	AGT	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818463
50	NC_017472	ACT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818463
51	NC_017472	TTA	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
52	NC_017472	TAT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
53	NC_017472	TAT	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
54	NC_017472	TAG	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818463
55	NC_017472	CAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818463
56	NC_017472	T	6	6	2431	2436	0 %	100 %	0 %	0 %	385818463
57	NC_017472	AAT	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818463
58	NC_017472	GCG	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818463
59	NC_017472	GCA	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818463
60	NC_017472	GCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818463
61	NC_017472	AGT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017472	TAA	2	6	2854	2859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818464
63	NC_017472	CTAA	2	8	2920	2927	50 %	25 %	0 %	25 %	385818464
64	NC_017472	TTA	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818464
65	NC_017472	TCCAA	2	10	2994	3003	40 %	20 %	0 %	40 %	385818464
66	NC_017472	CAT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818464
67	NC_017472	ATT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818464
68	NC_017472	AAT	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818464
69	NC_017472	TTC	3	9	3057	3065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818464
70	NC_017472	TTC	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818464
71	NC_017472	TTG	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818464
72	NC_017472	AATC	2	8	3221	3228	50 %	25 %	0 %	25 %	385818464
73	NC_017472	CA	3	6	3279	3284	50 %	0 %	0 %	50 %	385818464
74	NC_017472	T	6	6	3313	3318	0 %	100 %	0 %	0 %	385818464
75	NC_017472	CTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	385818464
76	NC_017472	GTA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818464
77	NC_017472	T	7	7	3478	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	385818464
78	NC_017472	AAT	2	6	3515	3520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818464
79	NC_017472	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818464
80	NC_017472	TTCT	2	8	3627	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	385818464
81	NC_017472	TTCC	2	8	3639	3646	0 %	50 %	0 %	50 %	385818464
82	NC_017472	AAAT	2	8	3661	3668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017472	CCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017472	TA	3	6	3690	3695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017472	AT	4	8	3726	3733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017472	AGC	2	6	3759	3764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017472	TAT	2	6	3799	3804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818465
88	NC_017472	ATATA	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	385818465
89	NC_017472	CTT	2	6	3881	3886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818465
90	NC_017472	ATC	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818465
91	NC_017472	T	6	6	3977	3982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017472	TGT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017472	ATTA	2	8	4048	4055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017472	AAT	2	6	4081	4086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017472	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017472	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017472	TA	3	6	4173	4178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017472	T	7	7	4193	4199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017472	A	6	6	4251	4256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017472	TAA	2	6	4290	4295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017472	GAA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017472	TTA	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017472	GCT	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017472	GCT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017472	TC	3	6	4498	4503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017472	AAAT	2	8	4556	4563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017472	GAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017472	GGCT	2	8	4602	4609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017472	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017472	CGT	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017472	TAC	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017472	TGA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017472	TTAT	2	8	4867	4874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017472	CTT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017472	ATTC	2	8	4940	4947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017472	TC	3	6	4974	4979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017472	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017472	GA	4	8	5061	5068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017472	AGC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017472	TAT	2	6	5107	5112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017472	A	6	6	5130	5135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017472	AAT	2	6	5164	5169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017472	T	6	6	5185	5190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017472	TGC	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017472	TTTAA	2	10	5283	5292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017472	TCA	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017472	TAT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017472	A	6	6	5364	5369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017472	TACTT	2	10	5381	5390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017472	TAA	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017472	AGT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017472	TAA	2	6	5451	5456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017472	A	6	6	5455	5460	100 %	0 %	0 %	0 %	385818466
134	NC_017472	TGA	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818466
135	NC_017472	GAT	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818466
136	NC_017472	CAG	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818466
137	NC_017472	A	6	6	5623	5628	100 %	0 %	0 %	0 %	385818466
138	NC_017472	TTA	2	6	5629	5634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818466
139	NC_017472	AATC	2	8	5650	5657	50 %	25 %	0 %	25 %	385818466
140	NC_017472	TAG	2	6	5689	5694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818466
141	NC_017472	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818466
142	NC_017472	ATT	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818466
143	NC_017472	TAC	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818466
144	NC_017472	CAAA	2	8	6012	6019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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392	NC_017472	A	6	6	16232	16237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_017472	TAAAC	2	10	16273	16282	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
394	NC_017472	ATT	2	6	16286	16291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818473
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397	NC_017472	AT	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	385818473
398	NC_017472	T	7	7	16423	16429	0 %	100 %	0 %	0 %	385818473
399	NC_017472	T	6	6	16431	16436	0 %	100 %	0 %	0 %	385818473
400	NC_017472	GAACT	2	10	16451	16460	40 %	20 %	20 %	20 %	385818473
401	NC_017472	TTCT	2	8	16479	16486	0 %	75 %	0 %	25 %	385818473
402	NC_017472	T	6	6	16503	16508	0 %	100 %	0 %	0 %	385818473
403	NC_017472	ATTG	2	8	16522	16529	25 %	50 %	25 %	0 %	385818473
404	NC_017472	TCC	2	6	16594	16599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
405	NC_017472	TAT	2	6	16617	16622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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